复旦大学牵头承担国家重点研发计划蛋白质机器与生命过程调控重点专项2016年度项目4项，分别是“病原菌核糖体调节因子的发现、鉴定及调控机制研究”、“表观遗传调控中关键蛋白质机器的结构功能研究”、“蛋白质组精准鉴定搜索引擎及技术体系”、“镁离子通道蛋白的结构和功能研究”。近期，在复旦大学召开了4个项目实施启动会，邀请同行专家对项目研究计划进行了深入论证，复旦大学科技处、相关院系和项目参与单位以及科技部高技术研究发展中心参加了会议。
    项目负责人李继喜研究员、徐彦辉教授、陆豪杰教授和服部素之研究员介绍了项目的总体情况，全面阐述了前期工作基础、项目实施方案、预期成果、管理机制、项目执行可能出现的难点和风险点的控制、研究任务分工、经费使用等。各课题负责人详细汇报了所承担的研究任务、实施方案、人员分工等进行了的。与会专家对项目及课题的研究目标、技术路线、工作计划等进行了评价，提出了意见和建议。
    “病原菌核糖体调节因子的发现、鉴定及调控机制研究”项目针对我国临床耐药严重的两类病原菌—结核分枝杆菌和肠杆菌，系统发现并鉴定新型核糖体结合/调控蛋白，探索与核糖体组装及蛋白质翻译相关的新调节因子和调控机制；深入研究细菌特有反式翻译拯救失活核糖体过程以及核糖体蛋白翻译后修饰过程，解析结构基础；系统研究细菌特异性核糖体开关与药物靶点关系，通过与哺乳动物核糖体比较，提高对抗生素药物靶点的认识，发现并验证相关抗菌药物新靶点，为新型高效抗生素的开发奠定理论基础。
    “表观遗传调控中关键蛋白质机器的结构功能研究”项目围绕表观遗传调控中关键蛋白质机器，以解析表观遗传调控蛋白质机器结构为切入点，研究复合物在核小体层面的动态过程，阐明相关组成、结构和功能，系统揭示调控基因表达和细胞命运决定的分子机制。项目将在分子水平上深入研究表观遗传调控的基本规律，推动表观遗传调控领域的发展，提升我国在表观遗传调控、结构生物学等领域的国际地位。
    “蛋白质组精准鉴定搜索引擎及技术体系”项目基于前期开发的我国首个具有自主知识产权的蛋白质鉴定搜索引擎和蛋白质组学分析技术体系，进一步提升蛋白质组数据分析的灵敏度、速度和精准度，建立具有自主知识产权的下一代蛋白质组精准鉴定搜索引擎及技术体系，助力实现我国在蛋白质研究领域的“领跑”。预期为生命系统中蛋白质机器的规模化研究提供重要技术支撑，为新药研发、医学诊断等领域提供更为可靠的蛋白质组学解决方案。
    “镁离子通道蛋白的结构和功能研究”项目以Mg²⁺通道蛋白家族中唯一未有全长结构报道的受ATP调控的CNNM和服部素之研究员在世界上率先进行结构解析的MgtE 为对象，采取结构生物学、电生理学及化合物虚拟筛选为主的方法，研究Mg²⁺通道的离子选择性、门控机制、相互作用蛋白等调控机制及新型Mg²⁺通道调控化合物的筛选和调控机制，揭示Mg²⁺通道的三维结构及动态变化机制，全面理解离子通道蛋白运输Mg²⁺的分子机制。
    作为项目牵头单位，复旦大学建立完善科研项目和经费分级管理体制，根据“统一领导、分级管理、责任到人”的原则，由校领导和职能部门、院系（所）、项目（课题）负责人三级管理架构组成。复旦大学高度重视项目执行过程中的管理与条件保障，针对蛋白质重点专项目标导向明确、资助强度大、任务重、时间紧、考核严的特点，加强管理、落实责任、挖掘潜力、提高效率，协调相关资源，保障任务实施。根据蛋白质重点专项国拨经费的新方式，改进了学校科研管理系统，积极协助各项目负责人及时做好经费拨付等工作。为确保项目的组织实施，加强专业化管理，学校鼓励项目负责人聘用科研财务助理，着手制定科研助理管理办法，筹备项目科研助理培训会，宣贯相关管理办法，提高科研助理专业素质。