蛋白质研究是国际生命科学和医学研究的最前沿领域，与医疗卫生、经济发展、战略安全等密切相关。近10年，蛋白质研究国家重大科学研究计划在蛋白质复合体与蛋白质机器、蛋白质组学、重大疾病相关蛋白质功能研究、蛋白质研究新技术新方法等方向进行了前瞻部署，建设了国家蛋白质设施等蛋白质研究的大科学装置，推动了我国蛋白质研究领域的跨越式发展，实现了部分重点研究方向的关键性突破。
    为保持我国蛋白质机器研究的领先态势，实现在部分重点领域引领国际前沿，确保与国家重大战略需求相关的蛋白质机器研究得到深入发展，国家重点研发计划设立了蛋白质机器与生命过程调控重点专项。科技部、教育部、中国科学院等部门组织专家编制了蛋白质机器与生命过程调控重点专项实施方案，专项于2016年2月启动。
    蛋白质机器与生命过程调控重点专项针对“重大生命过程中蛋白质机器动态组装与功能调控的分子机制”的核心科学问题，综合生物物理学、蛋白质组学、细胞生物学、化学生物学、生物影像学等技术手段，开展战略性、基础性和前瞻性研究，增强我国蛋白质机器研究的核心竞争力。
    蛋白质机器与生命过程调控重点专项围绕重大基础科学问题研究、重大技术方法研究和重大应用基础研究等三大任务进行部署。
    2016年，蛋白质机器与生命过程调控重点专项优先部署21个重要支持方向，33个项目（包括青年科学家项目10项）立项实施，中央财政安排经费支持7.3亿元。
    在重大基础科学问题研究方面部署了项目10项，青年科学家项目10项。主要支持细胞生命活动相关的蛋白质机器、肿瘤微环境对蛋白质机器的影响和调控、蛋白质膜转运的分子机制、植物特有蛋白质机器的分子机制、蛋白质翻译机器的调控、神经干细胞发育与细胞命运决定中的蛋白质机器、RNA-蛋白质复合机器与生命过程的调控、控制重要组织器官的系统发育与重塑的蛋白质机器研究等研究。
    在重大技术方法研究方面部署项目7项，主要支持高分辨率冷冻电镜、磁共振技术和化学生物学在结构生物学中应用，以及依托同步辐射光源的结构生物学新技术和新方法、新一代蛋白质组学分析技术研究、计算生物学的新技术新方法及应用的相关研究等研究。
    在重大应用基础研究方面部署项目6项，主要支持基于蛋白质机器的重要疾病（肿瘤和免疫类疾病、神经退行性疾病、代谢类疾病）的防治研究、病原体感染与致病过程中蛋白质机器的功能机制研究、免疫反应过程中蛋白质机器的功能机制研究以及基于蛋白质机器的重大疾病防治技术研究等研究。
    蛋白质机器与生命过程调控作为首批启动实施的重点专项，科技部高技术研究发展中心认真贯彻落实科技计划管理改革的各项要求，严格按照各项管理规定和管理流程，通过统一的国家科技信息管理系统，经过预申报、首轮评审、正式申报、视频评审答辩、立项论证等环节，实现了所有评审专家均从专家库中随机抽取以及专项组织全过程的规范化、痕迹化管理，做到了全流程“可申诉、可查询、可追溯”，构建了公开、公平的学术竞争环境。
    根据蛋白质机器与生命过程调控重点专项实施方案的总体设计，专项通过五年的实施，将在细胞周期、细胞能量与物质代谢、基因复制与转录、表观遗传、蛋白质合成与质量控制、重大疾病发生发展、感染与免疫等重大生理、病理过程相关蛋白质机器的研究中，产出一批国际领先、具有长远影响的标志性成果，实现重点研究方向对国际前沿的引领；为解决人口健康、医药与生物技术、现代农业、环境生态与能源、国家安全等领域的重大科学问题和发展关键技术提供基础理论引导和技术方法支撑；造就一批学科交叉、创新能力强的综合性、复合型的蛋白质研究高水平队伍，培育国际一流水平的科学家。