我国作为养殖大国，长期重视动物遗传育种科技创新。在科技部门长期支持的基础上，“十二五”863计划现代农业技术领域专门设置了动物分子与细胞工程育种技术主题。截止2015年底，2011年和2012年分批启动的“海水养殖种子工程”重大项目下属14个课题，“动物分子与细胞工程育种技术研究”主题项目下属7个课题以及“鲤鱼和草鱼等重要养殖鱼类功能基因组研究及应用”主题项目下属4个课题已经顺利完成执行期。3月15日，现代农业技术领域办组织专家组在北京召开“动物分子与细胞工程育种技术主题到期课题验收会”，对该主题下属25个课题进行了验收。桂建芳院士带领专家组听取了“基于全基因组信息信息的鱼类遗传育种”、“基于高密度SNP芯片的牛、猪基因组选择技术研究”、“鲤鱼等功能基因组资源开发及其数据库与网站构建”等25个课题的验收汇报，对各个课题论文、专利、产品等成果进行了核查，并与各个课题组进行了讨论质询，对部分课题取得的成果进行了凝练总结。

经过答辩，本批25个课题全部通过了技术验收，在论文发表、品种创制、平台建设等方面进展喜人。如中国海洋大学领头的“基于全基因组的贝类遗传选育”课题组完成了长牡蛎基因组图谱，成果发表于生物学权威期刊《Nature》上，在组学关键技术研发方面取得重要突破，研发了新型全基因组分型技术和算法，成果发表于《Nature Methods》。鲤鱼、半滑舌鳎基因组研究等成果发表于《Nature Genetics》。中国农业大学“基于高密度SNP芯片的牛、猪基因组选择技术研究”课题组首次在我国开展家畜全基因组选择技术研究，成功创建了牛、猪基因组选择育种技术平台，实现了家畜低成本的早期选育，提高了选种的准确性。目前该技术已在广东温氏食品集团种猪场和各大牛场得以应用。大黄鱼遗传图谱和分子标记构建、猪分子细胞工程育种技术创新和优势新品系培育等多项成果引人瞩目。

经过“十二五”863计划持续支持，畜禽和水产动物遗传育种取得较大突破，为“十三五”及今后发展我国动物种业积蓄了力量。